J'ai bien compris que la seule partie qui peut être modifié via le web, c'est dans myapp/var. Il y a par exemple themes, on imagine pouvoir installer des thèmes via un backoffice web.

Mais qu'en est-il des plugins ?

D'ailleurs, un thème, ce n'est pas que des tpl, il y a aussi des images et des css. Il faut forcément les mettre dans www mais du coup, on doit aussi pouvoir installer sur www via le web. Après, je dois faire par exemple :

 global $gJConfig;
 $rep = $this->getResponse('html');
 $rep->addCSSLink('design/'.$gJConfig->defaultTheme.'/layout.css');
 $rep->addCSSLink('design/'.$gJConfig->defaultTheme.'/style.css');

J'ai trouvé ca un peu curieux, c'est une partie de jelix où l'arborescence n'est pas imposée et j'ai du cherché moi même comment récupérer le nom du thème.

le www, tu fais ce que tu veux.

Pour ce qui est des themes, y a juste une base... On peut dire qu'il manque encore des choses effectivement. (rappelle toi que ce n'est qu'une alpha...)